RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.23□□□□□ -1.25
PHC3-211ENST00000486042 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.23□□□□□ -1.25
PHC3-211ENST00000486042 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PHC3-211ENST00000486042 FAM26DQ5JW98 314 aa7.22□□□□□ -1.25
PHC3-211ENST00000486042 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PHC3-211ENST00000486042 ZAR1Q86SH2 424 aa7.22□□□□□ -1.25
PHC3-211ENST00000486042 C14orf37Q86TY3 774 aa7.22□□□□□ -1.25
PHC3-211ENST00000486042 SHISA5Q8N114 240 aa7.22□□□□□ -1.25
PHC3-211ENST00000486042 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.22□□□□□ -1.25
PHC3-211ENST00000486042 NFKBIEO00221 500 aa7.21□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 ZAP70P43403 619 aa7.21□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 USP11P51784 963 aa7.21□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.21□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.21□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.21□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 SOX13Q9UN79 622 aa7.21□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 TNFRSF10BO14763 440 aa7.2□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 ADMP35318 185 aa7.2□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.2□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.2□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.2□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.2□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 ELP3Q9H9T3 547 aa7.2□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 CYP27A1Q02318 531 aa7.19□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 ZNF124Q15973 351 aa7.19□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.19□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 GPR152Q8TDT2 470 aa7.19□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.19□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 PKN1Q16512 942 aa7.18□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.18□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 GATA6Q92908 595 aa7.18□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.18□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.18□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.17□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 FAM170BA6NMN3 283 aa7.17□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 HGSNATQ68CP4 663 aa7.17□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.17□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.17□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 DRD2P14416 443 aa7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 IKBKEQ14164 716 aa7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 OCLNQ16625 522 aa7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 BSNDQ8WZ55 320 aa7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 USP26Q9BXU7 913 aa7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 CNTN3Q9P232 1028 aa7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 STIM2Q9P246 746 aa7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.15□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 XKR5Q6UX68 686 aa7.15□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.15□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 ABTB2Q8N961 1025 aa7.15□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 PMEPA1Q969W9 287 aa7.15□□□□□ -1.26
PHC3-211ENST00000486042 PRMT3O60678 531 aa7.14□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 DLGAP3O95886 979 aa7.14□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 CES1P23141 567 aa7.14□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 MAP7Q14244 749 aa7.14□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 PLCL1Q15111 1095 aa7.14□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 KSR1Q8IVT5 923 aa7.14□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.14□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 ZBTB39O15060 712 aa7.13□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 ACPPP15309 386 aa7.13□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 RFX1P22670 979 aa7.13□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.13□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 NXPE3Q969Y0 559 aa7.13□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.13□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.12□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.12□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.12□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 HHIPQ96QV1 700 aa7.12□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 SLC38A3Q99624 504 aa7.12□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 TRPA1O75762 1119 aa7.11□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.11□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 FAM168AQ92567 244 aa7.11□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PHC3-211ENST00000486042 MISP3Q96FF7 219 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms