RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
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RABGGTB-210ENST00000485459 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNA1Q09470 495 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
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RABGGTB-210ENST00000485459 EHD4Q9H223 541 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 NPHS2Q9NP85 383 aa7.88□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 ADAM11O75078 769 aa7.87□□□□□ -1.15
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RABGGTB-210ENST00000485459 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.87□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
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RABGGTB-210ENST00000485459 TMC7Q7Z402 723 aa7.86□□□□□ -1.15
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RABGGTB-210ENST00000485459 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.85□□□□□ -1.15
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RABGGTB-210ENST00000485459 PCDH1Q08174 1060 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 FDX2Q6P4F2 183 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 Q6ZS46 218 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 TCF12Q99081 682 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF208Q9H0X6 261 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-210ENST00000485459 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
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RABGGTB-210ENST00000485459 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-210ENST00000485459 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.83□□□□□ -1.16
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RABGGTB-210ENST00000485459 MAPK8P45983 427 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.79□□□□□ -1.16
RABGGTB-210ENST00000485459 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
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RABGGTB-210ENST00000485459 STOML1Q9UBI4 398 aa7.79□□□□□ -1.16
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RABGGTB-210ENST00000485459 FSTP19883 344 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 ITPKAP23677 461 aa7.77□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 MAOBP27338 520 aa7.77□□□□□ -1.17
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RABGGTB-210ENST00000485459 PI16Q6UXB8 463 aa7.77□□□□□ -1.17
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RABGGTB-210ENST00000485459 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.77□□□□□ -1.17
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RABGGTB-210ENST00000485459 MEGF11A6BM72 1044 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 B3GALT4O96024 378 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 BMP3P12645 472 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 FCGRTP55899 365 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 DSC3Q14574 896 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 POU4F3Q15319 338 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
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