RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 CD209Q9NNX6 404 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 ALDH1A1P00352 501 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 CERS5Q8N5B7 392 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 LAMB1P07942 1786 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 F8W031 263 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 IFNL1Q8IU54 200 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIM17Q9Y577 477 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 CLRN2A0PK11 232 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 TAF5LO75529 589 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 CSF1RP07333 972 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 CASP7P55210 303 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 WNK4Q96J92 1243 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 FLIIQ13045 1269 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 VEZTQ9HBM0 779 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 JAG2Q9Y219 1238 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 OTOFQ9HC10 1997 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 INHBEP58166 350 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 MAP3K11Q16584 847 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 CFAP100Q494V2 611 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.96□□□□□ -0.01
RABGEF1-207ENST00000484547 AOX1Q06278 1338 aa14.96□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 MYO1BO43795 1136 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 SPDYE6P0CI01 402 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 LINS1Q8NG48 757 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 POTEFA5A3E0 1075 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ANP32CO43423 234 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 IL1R1P14778 569 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 GJA5P36382 358 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 WWC1Q8IX03 1113 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.94□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 NEFLP07196 543 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CRHR2Q13324 411 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ERO1AQ96HE7 468 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PLIN1O60240 522 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 FOXO4P98177 505 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 RASA3Q14644 834 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC27Q2M243 656 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 GCC1Q96CN9 775 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 UNCXA6NJT0 531 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC184Q52MB2 194 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 PTPN18Q99952 460 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 ELP3Q9H9T3 547 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 F6X3S4 739 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 EFCC1Q9HA90 598 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CAP1Q01518 475 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGEF1-207ENST00000484547 IL16Q14005 1332 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 SP3Q02447 781 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 OPTNQ96CV9 577 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 VAMP4O75379 141 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGEF1-207ENST00000484547 TNFAIP1Q13829 316 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms