RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 UBE4AQ14139 1066 aa25.92■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 NPHP1O15259 732 aa25.91■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 GSE1Q14687 1217 aa25.91■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 TXNRD1Q16881 649 aa25.91■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.91■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.91■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 BRD1O95696 1058 aa25.91■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 ANKRD1Q15327 319 aa25.91■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 CNBD1Q8NA66 436 aa25.91■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 GYG1P46976 350 aa25.9■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 TRAK2O60296 914 aa25.89■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 NECAB1Q8N987 351 aa25.89■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
USP13-202ENST00000482333 E7EWF7 191 aa25.89■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 FGAP02671 866 aa25.89■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.88■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.87■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 MAP3K12Q12852 859 aa25.87■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.87■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.87■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 DTNBO60941 627 aa25.86■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 Q6ZUG5 572 aa25.86■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 KLRK1P26718 216 aa25.86■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 HAND2P61296 217 aa25.85■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.85■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.85■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 MCTP1Q6DN14 999 aa25.84■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.84■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.84■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 SERPINB2P05120 415 aa25.83■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 SLC51AQ86UW1 340 aa25.83■■□□□ 1.73
USP13-202ENST00000482333 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.82■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 GJB2P29033 226 aa25.82■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.82■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 AIDAQ96BJ3 306 aa25.82■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 PLSCR1O15162 318 aa25.82■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 DDR1Q08345 913 aa25.82■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 GRAPQ13588 217 aa25.82■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 BRF1Q92994 677 aa25.82■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 APBA3O96018 575 aa25.81■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 PTMSP20962 102 aa25.81■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 SYT1P21579 422 aa25.81■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 ZNF827Q17R98 1081 aa25.81■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 VPS37DQ86XT2 251 aa25.81■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.81■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 MBD4O95243 580 aa25.8■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 RXRBP28702 533 aa25.8■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 STK3Q13188 491 aa25.8■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.8■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 NBPF3Q9H094 633 aa25.8■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 ZNF213O14771 459 aa25.79■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 CRY2Q49AN0 593 aa25.79■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 ARMT1Q9H993 441 aa25.79■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.79■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 STX6O43752 255 aa25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 APPP05067 770 aa25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 ST5P78524 1137 aa25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 CHST3Q7LGC8 479 aa25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 FGD1P98174 961 aa25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 GTF3C6Q969F1 213 aa25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 AKT1S1Q96B36 256 aa25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 ABCF2Q9UG63 623 aa25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.78■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.77■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.76■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.72
USP13-202ENST00000482333 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 ALX1Q15699 326 aa25.76■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.76■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 LCORLQ8N3X6 602 aa25.76■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.76■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 SEMA3EO15041 775 aa25.75■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 APOBRQ0VD83 1088 aa25.75■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.75■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 RAI14Q9P0K7 980 aa25.75■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 CACNA1SQ13698 1873 aa25.75■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.74■■□□□ 1.71
USP13-202ENST00000482333 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms