RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MMP14P50281 582 aa26■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 OGFOD1Q8N543 542 aa26■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 DDX19BQ9UMR2 479 aa26■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 TRAF5O00463 557 aa25.99■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 TFCP2Q12800 502 aa25.99■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 SCARF1Q14162 830 aa25.99■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 PDE3AQ14432 1141 aa25.99■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.751e-28■■□□□ 12.1
ACTB-211ENST00000480301 CEP85Q6P2H3 762 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 CREBZFQ9NS37 354 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 USP48Q86UV5 1035 aa25.97■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.97■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 F8W031 263 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 TIMM10P62072 90 aa25.95■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 GGA3Q9NZ52 723 aa25.95■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 WNT10BO00744 389 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 ADORA1P30542 326 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 DLK2Q6UY11 383 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GUL7 405 aa25.93■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 CST9Q5W186 159 aa25.93■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 GRIK5Q16478 980 aa25.92■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 KLRG1Q96E93 195 aa25.92■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 ADM5C9JUS6 153 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 PHKA1P46020 1223 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 XAGE2Q96GT9 111 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 CCDC102BQ68D86 513 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 CEP350Q5VT06 3117 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.89■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB22O15209 634 aa25.89■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 DLGAP5Q15398 846 aa25.89■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 CFAP100Q494V2 611 aa25.89■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 SULF1Q8IWU6 871 aa25.89■■□□□ 1.74
ACTB-211ENST00000480301 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 GPR108Q9NPR9 543 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 SEMA3EO15041 775 aa25.86■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.86■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.86■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.86■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 SPDYE6P0CI01 402 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 AOX1Q06278 1338 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 CNTNAP1P78357 1384 aa25.84■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 RASSF10A6NK89 507 aa25.84■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.731e-6■■■□□ 18.7
ACTB-211ENST00000480301 TNNI3KQ59H18 835 aa25.84■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 CDCA5Q96FF9 252 aa25.84■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.84■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.84■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.84■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 CRKP46108 304 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 RASGRF1Q13972 1273 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 MRIQ9BWK5 157 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTB-211ENST00000480301 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.82■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 JMYQ8N9B5 988 aa25.82■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.82■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 HMMRO75330 724 aa25.81■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 GORABQ5T7V8 394 aa25.81■■□□□ 1.72
ACTB-211ENST00000480301 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.81■■□□□ 1.72
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