RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.63	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.63	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	CD209	Q9NNX6	404 aa		13.63	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.63	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.62	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	MYO1B	O43795	1136 aa		13.62	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	GNAI1	P63096	354 aa		13.62	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.62	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.62	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.62	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.62	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.62	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.62	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.62	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	KCNJ4	P48050	445 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	VEZT	Q9HBM0	779 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		13.61	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.6	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279		H7C1W4	665 aa		13.6	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	ITGA6	P23229	1130 aa		13.6	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.6	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.6	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279		H0YGN5	161 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	CHRND	Q07001	517 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	RASA3	Q14644	834 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APTX-222	ENST00000478279	CSF1R	P07333	972 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	IL1R1	P14778	569 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	AOX1	Q06278	1338 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	SNAP23	O00161	211 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	TAF5L	O75529	589 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	GTF2A2	P52657	109 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	CCL15	Q16663	113 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	CASP7	P55210	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	GCKR	Q14397	625 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.55	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	APAF1	O14727	1248 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	G2E3	Q7L622	706 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.54	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	TLR2	O60603	784 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	PRMT2	P55345	433 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	VGLL4	Q14135	290 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	KIF22	Q14807	665 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.53	□□□□□ -0.24
APTX-222	ENST00000478279	GNRH1	P01148	92 aa		13.52	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.52	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
APTX-222	ENST00000478279	DPF3	Q92784	378 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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