RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477552.1

PTPRD-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRD, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-209ENST00000477552 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.77□□□□□ -0.85
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PTPRD-209ENST00000477552 A1BGP04217 495 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 GSDMDP57764 484 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 STK3Q13188 491 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 SYCP1Q15431 976 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 WASHC4Q2M389 1173 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 METTL24Q5JXM2 366 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.77□□□□□ -0.85
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PTPRD-209ENST00000477552 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.77□□□□□ -0.85
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PTPRD-209ENST00000477552 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
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PTPRD-209ENST00000477552 CHD4Q14839 1912 aa9.76□□□□□ -0.85
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PTPRD-209ENST00000477552 CCP110O43303 1012 aa9.76□□□□□ -0.85
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PTPRD-209ENST00000477552 ME1P48163 572 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 MAP3K12Q12852 859 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 LRRC24Q50LG9 513 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 NLRP10Q86W26 655 aa9.75□□□□□ -0.85
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PTPRD-209ENST00000477552 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
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PTPRD-209ENST00000477552 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 CBX8Q9HC52 389 aa9.75□□□□□ -0.85
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PTPRD-209ENST00000477552 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
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PTPRD-209ENST00000477552 DRC7Q8IY82 874 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRD-209ENST00000477552 OSBP2Q969R2 916 aa9.74□□□□□ -0.85
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