RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 RASGRF1Q13972 1273 aa22.67■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 BCAMP50895 628 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 UBE3CQ15386 1083 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 DOCK2Q92608 1830 aa22.66■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 CPA1P15085 419 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 GPT2Q8TD30 523 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.65■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SYF2-204ENST00000476231 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 SERPINB2P05120 415 aa22.64■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 CYP21A2P08686 494 aa22.64■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 ST5P78524 1137 aa22.64■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 RPS6KB1P23443 525 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 AKT1S1Q96B36 256 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.63■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 MAP3K12Q12852 859 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD1Q15327 319 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 NEK1Q96PY6 1258 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.62■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 PDE6AP16499 860 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 GRAPQ13588 217 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 KLHL34Q8N239 644 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 GPAA1O43292 621 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 ZNF827Q17R98 1081 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.61■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.6■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 GYG1P46976 350 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 CRY2Q49AN0 593 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.59■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 FOXP2O15409 715 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 DDR1Q08345 913 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 VPS37DQ86XT2 251 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SYF2-204ENST00000476231 SEMA3EO15041 775 aa22.58■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.58■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.58■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 STX6O43752 255 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 CLCN1P35523 988 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 POTEAQ6S8J7 498 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB22O15209 634 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 FGAP02671 866 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 LAMA4Q16363 1823 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 SYT1P21579 422 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 AIDAQ96BJ3 306 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 E7EWF7 191 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 LARGE1O95461 756 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-204ENST00000476231 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.54■■□□□ 1.2
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