RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468570.1

SGIP1-208, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, human

TSL 3

Gene SGIP1, Length 324 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SGIP1-208	ENST00000468570	PRMT3	O60678	531 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	GPR152	Q8TDT2	470 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570		H3BRJ5	948 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	PTPRA	P18433	802 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SGIP1-208	ENST00000468570	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	KIF4A	O95239	1232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	TIAF1	O95411	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	CFP	P27918	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	CEP120	Q8N960	986 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570		A6NHS1	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM196B	A6NMK8	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570		B8ZZF3	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	ZBTB39	O15060	712 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	RAB6A	P20340	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	CD96	P40200	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	ZAP70	P43403	619 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	BNIP3	Q12983	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	WNT8B	Q93098	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	NFKBIE	O00221	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	PKN1	Q16512	942 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	ATCAY	Q86WG3	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM168A	Q92567	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	BIN1	O00499	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	USP11	P51784	963 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	CABP4	P57796	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	CTSB	P07858	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SGIP1-208	ENST00000468570	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	NFIC	P08651	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570		U3KQE9	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	METTL12	A8MUP2	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	RFX1	P22670	979 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	OCLN	Q16625	522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SGIP1-208	ENST00000468570	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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