RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.04□□□□□ -0.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.03□□□□□ -0.96
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RABGGTB-205ENST00000462042 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 ARL4DP49703 201 aa9.02□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.02□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 PIK3R2O00459 728 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 B3GALT4O96024 378 aa9.01□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 RELL1Q8IUW5 271 aa9.01□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 EPHA1P21709 976 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 BAG6P46379 1132 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 SVOPQ8N4V2 548 aa8.99□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.98□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 WHAMMQ8TF30 809 aa8.98□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 ENC1O14682 589 aa8.97□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 AP3B2Q13367 1082 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 C8orf37Q96NL8 207 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGGTB-205ENST00000462042 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.97□□□□□ -0.97
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RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01387J3KSC0 135 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-205ENST00000462042 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-205ENST00000462042 NME2P22392 152 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-205ENST00000462042 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
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RABGGTB-205ENST00000462042 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-205ENST00000462042 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.96□□□□□ -0.98
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RABGGTB-205ENST00000462042 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGEF15O94989 841 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-205ENST00000462042 CELA3AP09093 270 aa8.95□□□□□ -0.98
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RABGGTB-205ENST00000462042 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-205ENST00000462042 ILDR2Q71H61 639 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP11A1P05108 521 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGGTB-205ENST00000462042 LMNB1P20700 586 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGGTB-205ENST00000462042 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGGTB-205ENST00000462042 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
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