RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	NT5C2	P49902	561 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	GPAA1	O43292	621 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	ZAP70	P43403	619 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	BTAF1	O14981	1849 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	LY75	O60449	1722 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758		M0R2C6	588 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	FGFR2	P21802	821 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	STK3	Q13188	491 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	CPLX1	O14810	134 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB22	O15209	634 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	FGA	P02671	866 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	ADORA1	P30542	326 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	MCAM	P43121	646 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SCRN1	Q12765	414 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	WASF1	Q92558	559 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT23	Q9C075	422 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SEMA3E	O15041	775 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PRC1	O43663	620 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	RCAN1	P53805	252 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	REST	Q13127	1097 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	LAMB1	P07942	1786 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAMTS2	O95450	1211 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PDE6A	P16499	860 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS72	Q15906	364 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	NTSR2	O95665	410 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	APP	P05067	770 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25

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