RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.75■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 MMP14P50281 582 aa25.75■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 ATP2B3Q16720 1220 aa25.75■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.75■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 BCAMP50895 628 aa25.74■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 SCARF1Q14162 830 aa25.74■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.74■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.73■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 KLRG1Q96E93 195 aa25.73■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 ATP8B2P98198 1209 aa25.72■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.72■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 USP48Q86UV5 1035 aa25.72■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 F8W031 263 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 POLA2Q14181 598 aa25.71■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 COG6Q9Y2V7 657 aa25.71■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.71■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 TFCP2Q12800 502 aa25.7■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.72e-6■■■■□ 20.8
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VARS-218ENST00000459667 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.7■■□□□ 1.7
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VARS-218ENST00000459667 WNT10BO00744 389 aa25.69■■□□□ 1.7
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VARS-218ENST00000459667 CST9Q5W186 159 aa25.68■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.68■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
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VARS-218ENST00000459667 CEP85Q6P2H3 762 aa25.67■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 DLK2Q6UY11 383 aa25.67■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.67■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 CNTNAP1P78357 1384 aa25.67■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 PDE3AQ14432 1141 aa25.66■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 DLGAP5Q15398 846 aa25.66■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 A0A1B0GUL7 405 aa25.65■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 ADORA1P30542 326 aa25.65■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 TIMM10P62072 90 aa25.65■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.65■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
VARS-218ENST00000459667 PHKA1P46020 1223 aa25.64■■□□□ 1.7
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VARS-218ENST00000459667 RASSF10A6NK89 507 aa25.63■■□□□ 1.69
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VARS-218ENST00000459667 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.69
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VARS-218ENST00000459667 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.62■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 CCDC102BQ68D86 513 aa25.62■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 JMYQ8N9B5 988 aa25.62■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 CDCA5Q96FF9 252 aa25.62■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 XAGE2Q96GT9 111 aa25.62■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.62■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.62■■□□□ 1.69
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VARS-218ENST00000459667 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.62■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.61■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 SPDYE6P0CI01 402 aa25.61■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.61■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.61■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
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VARS-218ENST00000459667 MYO1BO43795 1136 aa25.6■■□□□ 1.69
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VARS-218ENST00000459667 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.59■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 CRKP46108 304 aa25.58■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 VEGFBP49765 207 aa25.58■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 GPR108Q9NPR9 543 aa25.58■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 MAST3O60307 1309 aa25.58■■□□□ 1.69
VARS-218ENST00000459667 ZBTB22O15209 634 aa25.57■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 GORABQ5T7V8 394 aa25.57■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
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VARS-218ENST00000459667 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
VARS-218ENST00000459667 RASGRF1Q13972 1273 aa25.56■■□□□ 1.68
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