RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 EVI5O60447 810 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 NTSR2O95665 410 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 ALDH1A1P00352 501 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 TM4SF4P48230 202 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 GRAPQ13588 217 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 SCARF1Q14162 830 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 DCTN1Q14203 1278 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 NECTIN2Q92692 538 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 CDCA5Q96FF9 252 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 SHTN1A0MZ66 631 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 YDJCA8MPS7 323 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 ECE2O60344 883 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 INHBEP58166 350 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 ARHGEF6Q15052 776 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 OGFOD1Q8N543 542 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 GGA3Q9NZ52 723 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 COL4A5P29400 1685 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 SNED1Q8TER0 1413 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.73□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 BCORQ6W2J9 1755 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 USP17L8P0C7I0 530 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 HIC1Q14526 733 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 NBPF11Q86T75 865 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 TRIM17Q9Y577 477 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 ERBB4Q15303 1308 aa6.72□□□□□ -1.33
CBX1-204ENST00000444685 EGFRP00533 1210 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 PSEN2P49810 448 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 RPS8P62241 208 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 AMHR2Q16671 573 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 NUP98P52948 1817 aa6.71□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 DLL1O00548 723 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 PTGDRQ13258 359 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 COPS6Q7L5N1 327 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 NLRP10Q86W26 655 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 ERO1AQ96HE7 468 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 POLLQ9UGP5 575 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 GGA1Q9UJY5 639 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.7□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 USP17L3A6NCW0 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 USP17L4A6NCW7 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 UFL1O94874 794 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 MMP14P50281 582 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 GPSM2P81274 684 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 PODNQ7Z5L7 613 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 SLC51AQ86UW1 340 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.69□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 PRKG1Q13976 671 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 MOB2Q70IA6 237 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CBX1-204ENST00000444685 FBXW7Q969H0 707 aa6.68□□□□□ -1.34
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