RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SKAP1Q86WV1 359 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINC1P01008 464 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CTAGE8P0CG41 777 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 RHBDL3P58872 404 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 KLC4Q9NSK0 619 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.43e-7■■■□□ 16.6
PTPRC-209ENST00000442510 CLIP1P30622 1438 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 BRD3Q15059 726 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 COQ7Q99807 217 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SDF4Q9BRK5 362 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 H3BQV1 296 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SUPT3HO75486 399 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GNAT1P11488 350 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 MLH1P40692 756 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K9P80192 1104 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TNIP1Q15025 636 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 C8orf34Q49A92 452 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SOGA3Q5TF21 947 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 IFFO2Q5TF58 517 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM23A6NLE4 172 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 DIAPH2O60879 1101 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CNGA1P29973 690 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 MYO1EQ12965 1108 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GCC1Q96CN9 775 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SIL1Q9H173 461 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 DDHD2O94830 711 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 EPS15P42566 896 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 MPP3Q13368 585 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 MIS12Q9H081 205 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SH2D4AQ9H788 454 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SYNCQ9H7C4 482 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINI2O75830 405 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CLCN6P51797 869 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 GNGT1P63211 74 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 KLC1Q07866 573 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 EVI5LQ96CN4 794 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 KRT82Q9NSB4 513 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 APOEP02649 317 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 KAZNQ674X7 775 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 AFAP1Q8N556 730 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 CARD6Q9BX69 1037 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.29□□□□□ -1.4
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