RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433137.1

MED28P4-201, Transcript of mediator complex subunit 28 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene MED28P4, Length 572 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28P4-201ENST00000433137 F11P03951 625 aa9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 INPP5BP32019 993 aa9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 DSC3Q14574 896 aa9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 GIPC2Q8TF65 315 aa9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.09□□□□□ -0.95
MED28P4-201ENST00000433137 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.08□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 THBS1P07996 1170 aa9.08□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 CPS1P31327 1500 aa9.08□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.08□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 PTSQ03393 145 aa9.07□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 TYRO3Q06418 890 aa9.07□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.07□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 CDK19Q9BWU1 502 aa9.07□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.07□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 TMEM94Q12767 1356 aa9.07□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 SLC35F4A4IF30 521 aa9.06□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 A6NHS1 94 aa9.06□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 USP5P45974 858 aa9.06□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 TMF1P82094 1093 aa9.06□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 PDE3BQ13370 1112 aa9.06□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 COL19A1Q14993 1142 aa9.06□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 EVC2Q86UK5 1308 aa9.05□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 ARSDP51689 593 aa9.05□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 EHHADHQ08426 723 aa9.05□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 PGBD3Q8N328 593 aa9.05□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.05□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.05□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.05□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.05□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 DISP3Q9P2K9 1392 aa9.04□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 PLCB3Q01970 1234 aa9.04□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 C8orf34Q49A92 452 aa9.04□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 NLRP8Q86W28 1048 aa9.04□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 CEP63Q96MT8 703 aa9.04□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.04□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.04□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 LCE2BO14633 110 aa9.03□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.03□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.03□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 TRIM47Q96LD4 638 aa9.03□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 SETDB2Q96T68 719 aa9.03□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.03□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.03□□□□□ -0.96
MED28P4-201ENST00000433137 PCSK2P16519 638 aa9.02□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 MAPK8P45983 427 aa9.02□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.02□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 SENP2Q9HC62 589 aa9.02□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.02□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 E9PSI1 815 aa9.01□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 ATF3P18847 181 aa9.01□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 DCCP43146 1447 aa9.01□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 DBN1Q16643 649 aa9.01□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 EFHC2Q5JST6 749 aa9.01□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 KIFC2Q96AC6 838 aa9.01□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.01□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 BRD7Q9NPI1 651 aa9.01□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 HCN2Q9UL51 889 aa9.01□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.01□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 ADGRB2O60241 1585 aa9□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 ORC1Q13415 861 aa9□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 MSH6P52701 1360 aa8.99□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 CCDC7Q96M83 1385 aa8.99□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.99□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 EFSO43281 561 aa8.99□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
MED28P4-201ENST00000433137 ORAI2Q96SN7 254 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms