RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCL15Q16663 113 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF790Q6PG37 636 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C17orf99Q6UX52 265 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MGAMO43451 1857 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WNT10BO00744 389 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRKCZQ05513 592 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SHHQ15465 462 aa11.81□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OTOFQ9HC10 1997 aa11.81□□□□□ -0.52
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMC4Q7Z404 712 aa11.8□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADCY3O60266 1144 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GTF2A2P52657 109 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OPTNQ96CV9 577 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EYA3Q99504 573 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PFASO15067 1338 aa11.79□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.79□□□□□ -0.52
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHOX2BQ99453 314 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLLQ9UGP5 575 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NTSR2O95665 410 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IREB2P48200 963 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRAPQ13588 217 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AAK1Q2M2I8 961 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUSD4Q5VX71 490 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF318Q5VUA4 2279 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYO9BQ13459 2157 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDE3AQ14432 1141 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP16Q9Y5T5 823 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C6orf229H3BNL8 230 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELNP15502 786 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GABRQQ9UN88 632 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELP3Q9H9T3 547 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAST2Q6P0Q8 1798 aa11.76□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCHS1Q96JQ0 3298 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPA4Q9UI42 421 aa11.75□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL6A1P12109 1028 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNQ1P51787 676 aa11.74□□□□□ -0.53
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.74□□□□□ -0.53
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF576Q9H609 170 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.74□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BTBD19C9JJ37 291 aa11.74□□□□□ -0.53
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SASH1O94885 1247 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.73□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL4A1P02462 1669 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPTP24298 496 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PODNQ7Z5L7 613 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UIMC1Q96RL1 719 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHD6Q8TD26 2715 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FLT3LGP49771 235 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MMP14P50281 582 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TFF2Q03403 129 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OGFOD1Q8N543 542 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.72□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 REV3LO60673 3130 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CETPP11597 493 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAJB2P25686 324 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPSM2P81274 684 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.71□□□□□ -0.53
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.71□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 G3V3G9 751 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAH12Q6ZR08 3092 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ECM29Q5VYK3 1845 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L3A6NCW0 530 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L4A6NCW7 530 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GFRA3O60609 400 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
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