RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RASGRF1Q13972 1273 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNQ5Q9NR82 932 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DENND2AQ9ULE3 1009 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SALL3Q9BXA9 1300 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SALL1Q9NSC2 1324 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPEF2Q9C093 1822 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CACNA1SQ13698 1873 aa10□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSMD14O00487 310 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPS12P25398 132 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GTF2IP78347 998 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPATA5Q8NB90 893 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GMLQ99445 158 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.99□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGSF3O75054 1194 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DDNO94850 711 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP5JP18859 108 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MX1P20591 662 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MCAMP43121 646 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCARF1Q14162 830 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CERS5Q8N5B7 392 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPATCH3Q96I76 525 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LNPKQ9C0E8 428 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STAP2Q9UGK3 403 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UTRNP46939 3433 aa9.98□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MMP14P50281 582 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCNN1DP51172 638 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DPF2Q92785 391 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AOX1Q06278 1338 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHD4Q14839 1912 aa9.97□□□□□ -0.81
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDE1AP54750 535 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PI16Q6UXB8 463 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PI4K2BQ8TCG2 481 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HAUS7Q99871 368 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MXD3Q9BW11 206 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 JAG2Q9Y219 1238 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.96□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IQCA1LA6NCM1 817 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ERC2O15083 957 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USP17L8P0C7I0 530 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDE4AP27815 886 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZAP70P43403 619 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXW7Q969H0 707 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRIQ9BWK5 157 aa9.95□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAST3O60307 1309 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POTECB2RU33 542 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRIK5Q16478 980 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MICALL2Q8IY33 904 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BOLA2Q9H3K6 86 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNRKQ9NRH2 765 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.94□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SBF1O95248 1867 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRDX5P30044 214 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EPS15P42566 896 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OGFOD1Q8N543 542 aa9.93□□□□□ -0.82
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms