RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.35■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.34■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.34■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.34■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.34■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.34■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 CACNA1FO60840 1977 aa23.34■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.33■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 CLRN2A0PK11 232 aa23.33■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYO1BO43795 1136 aa23.33■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 INHBEP58166 350 aa23.33■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 CFAP100Q494V2 611 aa23.33■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.33■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 IFNL1Q8IU54 200 aa23.33■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 WNK4Q96J92 1243 aa23.33■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 VEZTQ9HBM0 779 aa23.33■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 CENPFP49454 3210 aa23.33■■□□□ 1.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 A0A1B0GUL6 1792 aa23.32■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAP3K11Q16584 847 aa23.32■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 JAG2Q9Y219 1238 aa23.32■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM17Q9Y577 477 aa23.32■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 IL16Q14005 1332 aa23.32■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.31■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPDYE6P0CI01 402 aa23.31■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.31■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 IL1R1P14778 569 aa23.3■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC184Q52MB2 194 aa23.3■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 FOXO4P98177 505 aa23.29■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.29■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.29■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLIN1O60240 522 aa23.28■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.28■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 AOX1Q06278 1338 aa23.28■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 LAMB1P07942 1786 aa23.27■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 UNCXA6NJT0 531 aa23.27■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 F6X3S4 739 aa23.27■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.27■■□□□ 1.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 RASA3Q14644 834 aa23.26■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.26■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.26■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 VAMP4O75379 141 aa23.25■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 GJA5P36382 358 aa23.25■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 BEND3Q5T5X7 828 aa23.25■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.25■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.25■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 ERO1AQ96HE7 468 aa23.25■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.25■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 CRHR2Q13324 411 aa23.24■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.24■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.24■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 OTOFQ9HC10 1997 aa23.23■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 POTEFA5A3E0 1075 aa23.22■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 TNFAIP1Q13829 316 aa23.22■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 ELP3Q9H9T3 547 aa23.22■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.22■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.22■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 BRCA2P51587 3418 aa23.21■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 GRM8O00222 908 aa23.21■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.21■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 GCC1Q96CN9 775 aa23.21■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 EFCC1Q9HA90 598 aa23.21■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.2■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 OPTNQ96CV9 577 aa23.2■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTPN18Q99952 460 aa23.2■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.2■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 GYG1P46976 350 aa23.19■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 SP3Q02447 781 aa23.19■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBE4AQ14139 1066 aa23.18■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 WDR63Q8IWG1 891 aa23.18■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.17■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.17■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.17■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.16■■□□□ 1.3
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