RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 USP17L7P0C7H9 530 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 EPHA1P21709 976 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 BAG6P46379 1132 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 ADAM19Q9H013 955 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.23□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 TRIM11Q96F44 468 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 BCL11AQ9H165 835 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 SOX13Q9UN79 622 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 PPME1Q9Y570 386 aa7.22□□□□□ -1.25
RBM39-211ENST00000426951 LINC01387J3KSC0 135 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 ADAM23O75077 832 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 GSTT1P30711 240 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 CABP4P57796 275 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 PODNQ7Z5L7 613 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 PLVAPQ9BX97 442 aa7.21□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 GNB5O14775 395 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 ITPKAP23677 461 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 ZNF576Q9H609 170 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 H3BRJ5 948 aa7.19□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 CTSHP09668 335 aa7.19□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 IKBKEQ14164 716 aa7.19□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.19□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 FAM229AH3BQW9 127 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 FBXO24O75426 580 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 PCDH1Q08174 1060 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 HGSNATQ68CP4 663 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 A0A0A0MRY4 1105 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 PIK3R2O00459 728 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 FSCN2O14926 492 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 ITGAEP38570 1179 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 FAAP100Q0VG06 881 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 SETDB1Q15047 1291 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 ILDR2Q71H61 639 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 CRELD1Q96HD1 420 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 BACH2Q9BYV9 841 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 RAC1P63000 192 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 PIP4K2BP78356 416 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-211ENST00000426951 RECKO95980 971 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 B3GALT4O96024 378 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 COL8A1P27658 744 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 ARL4DP49703 201 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 GSTM4Q03013 218 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 USP31Q70CQ4 1352 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 VAMP1P23763 118 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 GRIK4Q16099 956 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 FBXO11Q86XK2 927 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 WNT8BQ93098 351 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RBM39-211ENST00000426951 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms