RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 SYT1P21579 422 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 GRIPAP1Q4V328 841 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 USP37Q86T82 979 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 CABP5Q9NP86 173 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 MBIPQ9NS73 344 aa12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPHP41219 470 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D5Q92609 795 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINA10Q9UK55 444 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT86O43790 486 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 STAT6P42226 847 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC2Q9BYS8 371 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 EBAG9O00559 213 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBB4BP68371 445 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAMTSL3P82987 1691 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ESR2Q92731 530 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 MEIS3Q99687 375 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa12.5□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 CTAGE9A4FU28 777 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 GNAQP50148 359 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PIP4K2BP78356 416 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT83P78385 493 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP12.49□□□□□ -0.417e-6■■□□□ 11.8
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 V9GYY5 206 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 HLA-DOAP06340 250 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBBP07437 444 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC42Q96M95 316 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT23Q9C075 422 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 KNDC1Q76NI1 1749 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 F13A1P00488 732 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB16Q05516 673 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 RTN1Q16799 776 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA1Q92805 767 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 MMRN2Q9H8L6 949 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 WASLO00401 505 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ANXA1P04083 346 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 MXRA7P84157 204 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAF1Q13077 416 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM75PA6NK02 468 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP2A1O14983 1001 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ASIC1P78348 528 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD44Q8N8A2 993 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX21Q969T3 373 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 RASAL2Q9UJF2 1139 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 SPTLC2O15270 562 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT13P13646 458 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 TYRO3Q06418 890 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 HS1BP3Q53T59 392 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC14Q96N46 770 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 CNNM2Q9H8M5 875 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD1Q99460 953 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PARD3Q8TEW0 1356 aa12.48□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM83GA6ND36 823 aa12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKS4BQ8N8V4 417 aa12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD24Q8TF21 1146 aa12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 SMC6Q96SB8 1091 aa12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 OTUD6BQ8N6M0 293 aa12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 BICD1Q96G01 975 aa12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNCQ9H7C4 482 aa12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 VAV2P52735 878 aa12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 LMBR1Q8WVP7 490 aa12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 NSD2O96028 1365 aa12.46□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa12.46□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP2B3Q16720 1220 aa12.46□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOC5O00471 708 aa12.46□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 PHACTR2O75167 634 aa12.46□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.46□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 MICALL1Q8N3F8 863 aa12.46□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 MSL1Q68DK7 614 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 Q6ZUG5 572 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP57Q86XR8 500 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 PLCB3Q01970 1234 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 CPLX4Q7Z7G2 160 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX58Q96C10 678 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ZEB2O60315 1214 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 ARID5AQ03989 594 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 USP32Q8NFA0 1604 aa12.45□□□□□ -0.42
EFTUD2-202ENST00000426333 MED14O60244 1454 aa12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms