RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412425.1

RAB6C-AS1-201, RAB6C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB6C-AS1, Length 2,454 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 COG6Q9Y2V7 657 aa8.4□□□□□ -1.06
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MARCH6O60337 910 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SASH3O75995 380 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 VDRP11473 427 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PTGS1P23219 599 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF394Q53GI3 561 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TMX3Q96JJ7 454 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SCLT1Q96NL6 688 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRIM4Q9C037 500 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.4□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PKN1Q16512 942 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BHMTQ93088 406 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MTRQ99707 1265 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CD248Q9HCU0 757 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 INCENPQ9NQS7 918 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ITM2BQ9Y287 266 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ERBINQ96RT1 1412 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TTC30AQ86WT1 665 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 UBXN4Q92575 508 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KCNN1Q92952 543 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PNMA2Q9UL42 364 aa8.39□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AFF2P51816 1311 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FRMD3A2A2Y4 597 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MYO1BO43795 1136 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 INPP5BP32019 993 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MAP3K9P80192 1104 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TLDC1Q6P9B6 456 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TPPPO94811 219 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SOGA3Q5TF21 947 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ALS2CR12Q96Q35 445 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 VPS18Q9P253 973 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.38□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PDE3AQ14432 1141 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRIM11Q96F44 468 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SRGAP3O43295 1099 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CAVIN2O95810 425 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SLC4A2P04920 1241 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MECOMQ03112 1051 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 POSTNQ15063 836 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DCCP43146 1447 aa8.37□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.36□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.36□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KIF15Q9NS87 1388 aa8.36□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PDLIM1O00151 329 aa8.36□□□□□ -1.07
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZEB2O60315 1214 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms