RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397301.5

TNNT3-208, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT3, Length 818 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNT3-208	ENST00000397301	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	TAF5L	O75529	589 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	GNAI2	P04899	355 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	FKBP1B	P68106	108 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	MTX1	Q13505	466 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	PDE3A	Q14432	1141 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	SNAP23	O00161	211 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	EYA2	O00167	538 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	ATP8B2	P98198	1209 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TNNT3-208	ENST00000397301	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301		G3V3G9	751 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	CIAO1	O76071	339 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	PDE8B	O95263	885 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	KLRK1	P26718	216 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	KCNJ4	P48050	445 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	GML	Q99445	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	SCARF1	Q14162	830 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	POLA2	Q14181	598 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	SIL1	Q9H173	461 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	TM4SF4	P48230	202 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	HTT	P42858	3142 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	FGFR2	P21802	821 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	BRCA2	P51587	3418 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	GPR25	O00155	361 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	TBC1D8	O95759	1140 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	IL1R1	P14778	569 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TNNT3-208	ENST00000397301	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TNNT3-208	ENST00000397301	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
TNNT3-208	ENST00000397301	GYG1	P46976	350 aa		11.58	□□□□□ -0.56
TNNT3-208	ENST00000397301	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.58	□□□□□ -0.56

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