RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
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PGGT1B-202ENST00000379615 GORABQ5T7V8 394 aa18.97■□□□□ 0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 CHADLQ6NUI6 762 aa18.97■□□□□ 0.63
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.97■□□□□ 0.63
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PGGT1B-202ENST00000379615 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
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PGGT1B-202ENST00000379615 SERPINA10Q9UK55 444 aa18.87■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.86■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 MYO1BO43795 1136 aa18.86■□□□□ 0.61
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PGGT1B-202ENST00000379615 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
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PGGT1B-202ENST00000379615 RASGRF1Q13972 1273 aa18.86■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 MTMR14Q8NCE2 650 aa18.86■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 MRIQ9BWK5 157 aa18.86■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 SULF1Q8IWU6 871 aa18.85■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA5Q8NB90 893 aa18.85■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.84■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 WNT10BO00744 389 aa18.84■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP100Q494V2 611 aa18.84■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.84■□□□□ 0.61
PGGT1B-202ENST00000379615 TNS4Q8IZW8 715 aa18.84■□□□□ 0.61
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