RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC10A4Q96EP9 437 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 FANCIQ9NVI1 1328 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 BEND3Q5T5X7 828 aa16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TRAPPC3-201ENST00000373159 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 MYO1BO43795 1136 aa16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPDYE6P0CI01 402 aa16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 CFAP100Q494V2 611 aa16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 FZD1Q9UP38 647 aa16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 F6X3S4 739 aa16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 IFNL1Q8IU54 200 aa16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 F8W031 263 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 WNK4Q96J92 1243 aa16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPEF2Q9C093 1822 aa16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 CLRN2A0PK11 232 aa16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 GRM8O00222 908 aa16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 USP2O75604 605 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 IREB2P48200 963 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 RASA3Q14644 834 aa16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 VEZTQ9HBM0 779 aa16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 MRS2Q9HD23 443 aa16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 CNNM1Q9NRU3 951 aa16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLIN1O60240 522 aa16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 ALDH1L1O75891 902 aa16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBE4AQ14139 1066 aa16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 JAG2Q9Y219 1238 aa16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 AOX1Q06278 1338 aa16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 SSC5DA1L4H1 1573 aa16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 CACNA1FO60840 1977 aa16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRIM17Q9Y577 477 aa16.57■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 TNFAIP1Q13829 316 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 GJA5P36382 358 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 ERO1AQ96HE7 468 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 PTPN18Q99952 460 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 GYG1P46976 350 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 KAZALD1Q96I82 304 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 TEPSINQ96N21 525 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 CRHR2Q13324 411 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC4A10Q6U841 1118 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 UTYO14607 1347 aa16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 SP3Q02447 781 aa16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 OPTNQ96CV9 577 aa16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 SUCLG2Q96I99 432 aa16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 ELP3Q9H9T3 547 aa16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANP32CO43423 234 aa16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC3-201ENST00000373159 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 293.1 ms