RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 C7P10643 843 aa13.22□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 ITGA6P23229 1130 aa13.22□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 GCKRQ14397 625 aa13.22□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 IER5LQ5T953 404 aa13.22□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 MRS2Q9HD23 443 aa13.22□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.21□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.21□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 DACT2Q5SW24 774 aa13.21□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 TXNRD3Q86VQ6 643 aa13.21□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 DNAAF4Q8WXU2 420 aa13.21□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 MPHOSPH8Q99549 860 aa13.21□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 COA1Q9GZY4 146 aa13.21□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.21□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 RNF186Q9NXI6 227 aa13.21□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 METRNQ9UJH8 293 aa13.21□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 LEMD3Q9Y2U8 911 aa13.21□□□□□ -0.29
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1B0GUL6 1792 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF804BA4D1E1 1349 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 TRPA1O75762 1119 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 KLRK1P26718 216 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 NBPF9Q3BBW0 867 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 MOB2Q70IA6 237 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 OGFOD1Q8N543 542 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 SAGE1Q9NXZ1 904 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 CACNA1FO60840 1977 aa13.2□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 MYO3BQ8WXR4 1341 aa13.19□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 KCNJ4P48050 445 aa13.19□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 CASP7P55210 303 aa13.19□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 FKBP1BP68106 108 aa13.19□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 STRIP1Q5VSL9 837 aa13.19□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 LINS1Q8NG48 757 aa13.19□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 CSRNP1Q96S65 589 aa13.19□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 ANKRD2Q9GZV1 360 aa13.19□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 TAOK2Q9UL54 1235 aa13.19□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 WNT10BO00744 389 aa13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 VAMP4O75379 141 aa13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 SASH1O94885 1247 aa13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 CSF1RP07333 972 aa13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 GTF2IP78347 998 aa13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 CHRNDQ07001 517 aa13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 CHMP3Q9Y3E7 222 aa13.18□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 F6X3S4 739 aa13.17□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 ANP32CO43423 234 aa13.17□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 KIAA0825Q8IV33 1275 aa13.17□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 HDAC9Q9UKV0 1011 aa13.17□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 SNAP23O00161 211 aa13.16□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 TAF5LO75529 589 aa13.16□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 NF2P35240 595 aa13.16□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 WDR63Q8IWG1 891 aa13.16□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 CD209Q9NNX6 404 aa13.16□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 RGS19P49795 217 aa13.15□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 FOXO4P98177 505 aa13.15□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 PRKG1Q13976 671 aa13.15□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 ECM29Q5VYK3 1845 aa13.15□□□□□ -0.3
CLRN3-201ENST00000368671 POTEFA5A3E0 1075 aa13.14□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 BEND3Q5T5X7 828 aa13.14□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 F8W031 263 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 PLIN1O60240 522 aa13.13□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 MMP14P50281 582 aa13.13□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 TAF7LQ5H9L4 462 aa13.13□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 LMBR1LQ6UX01 489 aa13.13□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 ARMC9Q7Z3E5 817 aa13.13□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 IRS2Q9Y4H2 1338 aa13.13□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 GRM8O00222 908 aa13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 TBC1D8O95759 1140 aa13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 SOX10P56693 466 aa13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 DLGAP5Q15398 846 aa13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC57Q2TAC2 916 aa13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 EPHA10Q5JZY3 1008 aa13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF804AQ7Z570 1209 aa13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 FAM9BQ8IZU0 186 aa13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 CERS5Q8N5B7 392 aa13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 FZD1Q9UP38 647 aa13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 JAG2Q9Y219 1238 aa13.12□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 SLC4A10Q6U841 1118 aa13.11□□□□□ -0.31
CLRN3-201ENST00000368671 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms