RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 ITGB4P16144 1822 aa20.1■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 APPBP2Q92624 585 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 AIFM3Q96NN9 605 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 LAMA4Q16363 1823 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 PDE8AO60658 829 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 ANTXR2P58335 489 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 USP28Q96RU2 1077 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 MYL10Q9BUA6 226 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 TNMDQ9H2S6 317 aa20.09■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 ZNF213O14771 459 aa20.08■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TTC13-202ENST00000366662 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.08■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.08■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 PAPPAQ13219 1627 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 BCAMP50895 628 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 RFX7Q2KHR2 1363 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 NBPF3Q9H094 633 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 B4E1Z4 1266 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 MAP3K11Q16584 847 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 SMIM22K7EJ46 135 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 PRKAB2O43741 272 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 SIK1P57059 783 aa20.06■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 ADD2P35612 726 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 TYRO3Q06418 890 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 PDE6AP16499 860 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 RASGRF1Q13972 1273 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 MAP7D2Q96T17 732 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 ARMT1Q9H993 441 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.05■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 CCDC192P0DO97 292 aa20.04■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.04■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.04■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.04■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 SLIT2O94813 1529 aa20.04■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.04■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.04■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 TOMM22Q9NS69 142 aa20.04■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 DISP2A7MBM2 1401 aa20.03■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.03■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.03■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 PHKBQ93100 1093 aa20.03■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.03■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.03■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 MCM5P33992 734 aa20.02■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 ME1P48163 572 aa20.02■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 MICU3Q86XE3 530 aa20.02■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 NCOA7Q8NI08 942 aa20.02■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.82e-7■■■■□ 20.8
TTC13-202ENST00000366662 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.02■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 AIDAQ96BJ3 306 aa20.02■□□□□ 0.8
TTC13-202ENST00000366662 CPLX1O14810 134 aa20.02■□□□□ 0.79
TTC13-202ENST00000366662 MBD4O95243 580 aa20.01■□□□□ 0.79
TTC13-202ENST00000366662 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
TTC13-202ENST00000366662 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms