RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 OSGEPQ9NPF4 335 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 TM4SF5O14894 197 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOMEZQ8IX15 550 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHDC7BQ96G42 594 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAK1Q9UPV9 953 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAM11O75078 769 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 WISP1O95388 367 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOS3P29474 1203 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 IREB2P48200 963 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 NLRP12P59046 1061 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP2B2Q01814 1243 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRM2Q14416 872 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUOXA2Q1HG44 320 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 PI16Q6UXB8 463 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACAD11Q709F0 780 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBF1Q8TES7 1133 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCB6Q9NP58 842 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNK4Q9NYG8 393 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 F8W735 103 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDH1Q08174 1060 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 DOC2BQ14184 412 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 HGSNATQ68CP4 663 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF576Q9H609 170 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALX3O95076 343 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITPKAP23677 461 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 SETDB2Q96T68 719 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCO2Q9BYV7 579 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
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RNU6-552P-201ENST00000362869 GLB1P16278 677 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCGRTP55899 365 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSTM4Q03013 218 aa5.63□□□□□ -1.51
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RNU6-552P-201ENST00000362869 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZS46 218 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 TP53INP1Q96A56 240 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP26Q9BXU7 913 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP4R2Q9NY27 417 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 B3GALT4O96024 378 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF423Q2M1K9 1284 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 RUSC1Q9BVN2 902 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP41Q9BYV8 373 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF208Q9H0X6 261 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPG7Q9UQ90 795 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB7CA1YPR0 619 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL19A1Q14993 1142 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP11A1P05108 521 aa5.6□□□□□ -1.51
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RNU6-552P-201ENST00000362869 FGD1P98174 961 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 FDX2Q6P4F2 183 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
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