RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343217.6

DUSP28-201, Transcript of dual specificity phosphatase 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene DUSP28, Length 1,555 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28-201ENST00000343217 A0A1B0GUL7 405 aa25.33■■□□□ 1.65
DUSP28-201ENST00000343217 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
DUSP28-201ENST00000343217 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.33■■□□□ 1.65
DUSP28-201ENST00000343217 CNTNAP1P78357 1384 aa25.33■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 SEC24BO95487 1268 aa25.32■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 ATP5JP18859 108 aa25.32■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 IFFO2Q5TF58 517 aa25.32■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.32■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 RILPL2Q969X0 211 aa25.32■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.32■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 C6orf229H3BNL8 230 aa25.31■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.31■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.31■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.31■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 PDE8BO95263 885 aa25.31■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.31■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 EYA3Q99504 573 aa25.31■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 TIMM10P62072 90 aa25.3■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.3■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 SPEF2Q9C093 1822 aa25.29■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 RIMBP2O15034 1052 aa25.29■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 ATP2B3Q16720 1220 aa25.29■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 EVI5LQ96CN4 794 aa25.29■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 SCN9AQ15858 1988 aa25.29■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 PSMD14O00487 310 aa25.27■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.27■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.27■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.27■■□□□ 1.64
DUSP28-201ENST00000343217 ECE2O60344 883 aa25.26■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 GORABQ5T7V8 394 aa25.26■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 LPIN2Q92539 896 aa25.26■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 DPF2Q92785 391 aa25.26■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 XAGE2Q96GT9 111 aa25.26■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.26■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 GGA1Q9UJY5 639 aa25.26■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 RASSF10A6NK89 507 aa25.25■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 UFL1O94874 794 aa25.25■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 DOK7Q18PE1 504 aa25.25■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 PSME4Q14997 1843 aa25.25■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 CHMLP26374 656 aa25.24■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 HAUS7Q99871 368 aa25.24■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.24■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 XDHP47989 1333 aa25.24■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.24■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 SHTN1A0MZ66 631 aa25.23■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 CHRNDQ07001 517 aa25.23■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.23■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 HIP1O00291 1037 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 SLC5A1P13866 664 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 FGFR2P21802 821 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 VEGFBP49765 207 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 TICAM2Q86XR7 235 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 MICALL2Q8IY33 904 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 H7C1D1 291 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 TRAF5O00463 557 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 REC8O95072 547 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.21■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 A0A1B0GUL6 1792 aa25.21■■□□□ 1.63
DUSP28-201ENST00000343217 ATP2B4P23634 1241 aa25.2■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 ADORA1P30542 326 aa25.2■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.2■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 CST9Q5W186 159 aa25.2■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.2■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.2■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.19■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.19■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 UBE4AQ14139 1066 aa25.18■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.18■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 TAF5LO75529 589 aa25.18■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.18■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.17■■□□□ 1.62
DUSP28-201ENST00000343217 FSD1Q9BTV5 496 aa25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms