RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF213O14771 459 aa22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 TPM2P07951 284 aa22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC102BQ68D86 513 aa22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 PDE8BO95263 885 aa22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.77■■□□□ 1.24
TM7SF3-201ENST00000343028 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 PDE8AO60658 829 aa22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 ANTXR2P58335 489 aa22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 FBXW7Q969H0 707 aa22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 FBXO3Q9UK99 471 aa22.76■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 SUSD4Q5VX71 490 aa22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 CFAP45Q9UL16 551 aa22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 ADD2P35612 726 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP6V1AP38606 617 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 NBPF3Q9H094 633 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.74■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 MCM5P33992 734 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 KCNQ4P56696 695 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 NCOA7Q8NI08 942 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 SENP2Q9HC62 589 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 NUP98P52948 1817 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 ME1P48163 572 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 CBX8Q9HC52 389 aa22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 DISP2A7MBM2 1401 aa22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 SMIM5Q71RC9 77 aa22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 AIFM3Q96NN9 605 aa22.72■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 CPLX1O14810 134 aa22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 PDE6AP16499 860 aa22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TM7SF3-201ENST00000343028 LRP6O75581 1613 aa22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 B4E1Z4 1266 aa22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 DDB1Q16531 1140 aa22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF3AQ9Y496 699 aa22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 SLIT2O94813 1529 aa22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 SPEF2Q9C093 1822 aa22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 MYL10Q9BUA6 226 aa22.7■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 C8orf76Q96K31 380 aa22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 MYH3P11055 1940 aa22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 RASGRF1Q13972 1273 aa22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 AIDAQ96BJ3 306 aa22.69■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 TRDNQ13061 729 aa22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 ITPK1Q13572 414 aa22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF165P49910 485 aa22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 BCAMP50895 628 aa22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 CLIC4Q9Y696 253 aa22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 MYH7P12883 1935 aa22.68■■□□□ 1.22
TM7SF3-201ENST00000343028 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms