RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
UPP1-201ENST00000331803 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.89■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.88■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 GPAA1O43292 621 aa22.88■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.88■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.87■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 FOXP2O15409 715 aa22.87■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 RPS6KB1P23443 525 aa22.87■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.87■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 NEK1Q96PY6 1258 aa22.87■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 KLRK1P26718 216 aa22.86■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.86■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.86■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.86■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.86■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.86■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 DOCK2Q92608 1830 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.85■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 SEMA3EO15041 775 aa22.84■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 FGAP02671 866 aa22.84■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.84■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.84■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.84■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 NUCB2P80303 420 aa22.83■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD1Q15327 319 aa22.83■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.83■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 AIDAQ96BJ3 306 aa22.83■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 XDHP47989 1333 aa22.83■■□□□ 1.25
UPP1-201ENST00000331803 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 A0A0G2JLW4 131 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 BBOX1O75936 387 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 SLC51AQ86UW1 340 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 ABCF2Q9UG63 623 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.82■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 E7EWF7 191 aa22.81■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 MMP10P09238 476 aa22.81■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.8■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 LARGE1O95461 756 aa22.8■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 RAI14Q9P0K7 980 aa22.8■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.8■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 APPP05067 770 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 GPSM2P81274 684 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 SLC15A2Q16348 729 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.79■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 MBD4O95243 580 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 MCM4P33991 863 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 PKP1Q13835 747 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 ME3Q16798 604 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 MSL1Q68DK7 614 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 ZNF213O14771 459 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB22O15209 634 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 HAND2P61296 217 aa22.78■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 CYP7A1P22680 504 aa22.77■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 ARMT1Q9H993 441 aa22.77■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 STK32BQ9NY57 414 aa22.77■■□□□ 1.24
UPP1-201ENST00000331803 Q6ZUG5 572 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 SRGNP10124 158 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 ATP2B4P23634 1241 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 PDE6BP35913 854 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 TMC4Q7Z404 712 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 GBP4Q96PP9 640 aa22.76■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 GNAT2P19087 354 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 ALX1Q15699 326 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 GGA1Q9UJY5 639 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-201ENST00000331803 LCORLQ8N3X6 602 aa22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms