RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF804AQ7Z570 1209 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 CNTROBQ8N137 903 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 SNAP23O00161 211 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 PHKA1P46020 1223 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 BCAMP50895 628 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 COA1Q9GZY4 146 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 C21orf2O43822 256 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 MCAMP43121 646 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.16□□□□□ -1.26
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PDE4D-202ENST00000317118 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 BOLA2Q9H3K6 86 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 CACNA1SQ13698 1873 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 SALL1Q9NSC2 1324 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 C6orf229H3BNL8 230 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 HIP1O00291 1037 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 GYG1P46976 350 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 WASHC4Q2M389 1173 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 SLC51AQ86UW1 340 aa7.16□□□□□ -1.26
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PDE4D-202ENST00000317118 SYT17Q9BSW7 474 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 CDC45O75419 566 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 KLRK1P26718 216 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 RASGRF1Q13972 1273 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 OLFM4Q6UX06 510 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 PODNQ7Z5L7 613 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 CD209Q9NNX6 404 aa7.15□□□□□ -1.26
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PDE4D-202ENST00000317118 SCARF1Q14162 830 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-202ENST00000317118 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-202ENST00000317118 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-202ENST00000317118 BCS1LQ9Y276 419 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 DOCK2Q92608 1830 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-202ENST00000317118 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.14□□□□□ -1.27
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PDE4D-202ENST00000317118 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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PDE4D-202ENST00000317118 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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PDE4D-202ENST00000317118 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
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PDE4D-202ENST00000317118 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDE4D-202ENST00000317118 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 MAP3K12Q12852 859 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 STRIP1Q5VSL9 837 aa7.13□□□□□ -1.27
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PDE4D-202ENST00000317118 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 PPIP5K2O43314 1243 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 ECE2O60344 883 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 ADD2P35612 726 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 AOC3Q16853 763 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 MAST2Q6P0Q8 1798 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 G3V3G9 751 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 MMP14P50281 582 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-202ENST00000317118 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.12□□□□□ -1.27
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