RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 DBNDD1Q9H9R9 158 aa19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 PDE8BO95263 885 aa19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 IL15P40933 162 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 NIM1KQ8IY84 436 aa19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 ECHDC1Q9NTX5 307 aa19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 PALD1Q9ULE6 856 aa19.06■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 G3V3G9 751 aa19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 YY1P25490 414 aa19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 DCAF8Q5TAQ9 597 aa19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 VGLL2Q8N8G2 317 aa19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 IL17RAQ96F46 866 aa19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 CEP126Q9P2H0 1117 aa19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXO3Q9UK99 471 aa19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 SASH1O94885 1247 aa19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 GPATCH3Q96I76 525 aa19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 VPS33BQ9H267 617 aa19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 IL25Q9H293 177 aa19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 TIAM2Q8IVF5 1701 aa19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 SGSM2O43147 1006 aa19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 MCM2P49736 904 aa19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 TFCP2Q12800 502 aa19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 NUCB2P80303 420 aa19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 AACSQ86V21 672 aa19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 UBE4AQ14139 1066 aa19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 CLEC17AQ6ZS10 378 aa19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 MED23Q9ULK4 1368 aa19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1-201ENST00000307180 ECE2O60344 883 aa19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 PTMSP20962 102 aa19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 HSPA4P34932 840 aa19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 YDJCA8MPS7 323 aa19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNQ5Q9NR82 932 aa19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNRF3Q9ULT6 936 aa19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF541Q9H0D2 1346 aa19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 FZD9O00144 591 aa19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 RAD17O75943 681 aa19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 GYG1P46976 350 aa19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 FGFR2P21802 821 aa19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF6P56537 245 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 TIMM10P62072 90 aa19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP2B3Q16720 1220 aa19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 TMX3Q96JJ7 454 aa19■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 IRS2Q9Y4H2 1338 aa18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 GJA3Q9Y6H8 435 aa18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC5A1P13866 664 aa18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 LPIN2Q92539 896 aa18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 EVI5LQ96CN4 794 aa18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 RAD50Q92878 1312 aa18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 CXCL9Q07325 125 aa18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXW7Q969H0 707 aa18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1B0GUL7 405 aa18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 BCAMP50895 628 aa18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF804AQ7Z570 1209 aa18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 VPS37DQ86XT2 251 aa18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 COA1Q9GZY4 146 aa18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 CD209Q9NNX6 404 aa18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 GLTPD2A6NH11 291 aa18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 ADORA1P30542 326 aa18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 CUL4AQ13619 759 aa18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 CAVIN4Q5BKX8 364 aa18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 AKAP2Q9Y2D5 859 aa18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 CIAPIN1Q6FI81 312 aa18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 PODNQ7Z5L7 613 aa18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1-201ENST00000307180 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 JAG2Q9Y219 1238 aa18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 SCN9AQ15858 1988 aa18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 PSMD14O00487 310 aa18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 PKP1Q13835 747 aa18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 TNNI3KQ59H18 835 aa18.94■□□□□ 0.62
TSNARE1-201ENST00000307180 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms