RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 JAK2O60674 1132 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BRD3Q15059 726 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LGR6Q9HBX8 967 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PACS2Q86VP3 889 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 STK3Q13188 491 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 JCADQ9P266 1359 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FSIP1Q8NA03 581 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPM1EQ8WY54 764 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATP2B1P20020 1258 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GOLGA1Q92805 767 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDX11Q96FC9 970 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EPC1Q9H2F5 836 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ABCC6O95255 1503 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TXLNAP40222 546 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PSEN1P49768 467 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 APOBRQ0VD83 1088 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MED23Q9ULK4 1368 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CORO7P57737 925 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KRT32Q14532 448 aa20.59■□□□□ 0.89
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TRAPPC2L-201ENST00000301021 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FAM227BQ96M60 508 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP28Q96RU2 1077 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CPP00450 1065 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SDF4Q9BRK5 362 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DEF6Q9H4E7 631 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2L-201ENST00000301021 IKBKBO14920 756 aa20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGAP6O43182 974 aa20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FANCCQ00597 558 aa20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A1W2PQ27 194 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A1W2PQ64 194 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A1W2PQD8 194 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 VPS18Q9P253 973 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CBFA2T2O43439 604 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ME1P48163 572 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NLRP12P59046 1061 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MTX1Q13505 466 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ADALQ6DHV7 355 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HDXQ7Z353 690 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POTEB2H3BUK9 544 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 USP5P45974 858 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FBXW7Q969H0 707 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KIFC2Q96AC6 838 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MEGF6O75095 1541 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NEDD4P46934 1319 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GNG11P61952 73 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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