RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 MCM7P33993 719 aa27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 CPLX4Q7Z7G2 160 aa27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM76AQ8TAV0 307 aa27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM23A6NLE4 172 aa27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 TSGA10Q9BZW7 698 aa27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 IGSF3O75054 1194 aa27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT79Q5XKE5 535 aa27.31■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 CNGA4Q8IV77 575 aa27.3■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF3C6Q969F1 213 aa27.3■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBBP07437 444 aa27.3■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 TERF1P54274 439 aa27.3■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 RBSNQ9H1K0 784 aa27.3■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 EEF2P13639 858 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 GNAT2P19087 354 aa27.3■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD50Q92878 1312 aa27.3■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC50Q8IVM0 306 aa27.3■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB16Q05516 673 aa27.3■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 MYL5Q02045 173 aa27.29■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC39A6Q13433 755 aa27.29■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa27.29■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 SMC6Q96SB8 1091 aa27.29■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP2R3AQ06190 1150 aa27.29■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 VAMP4O75379 141 aa27.29■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.29■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 ERO1AQ96HE7 468 aa27.29■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 ELP1O95163 1332 aa27.29■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 EVCP57679 992 aa27.28■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 TNNC1P63316 161 aa27.28■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.28■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 NBPF4Q96M43 638 aa27.28■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAF1Q13077 416 aa27.28■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPYL6Q8N831 410 aa27.28■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC114Q96M63 670 aa27.28■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R9BQ96SB3 815 aa27.28■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 ATL3Q6DD88 541 aa27.28■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
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GNPTAB-201ENST00000299314 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.28■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
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GNPTAB-201ENST00000299314 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.27■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GVL5 298 aa27.27■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM160A1Q05DH4 1040 aa27.27■■□□□ 1.96
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC122Q5T0U0 273 aa27.27■■□□□ 1.96
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GNPTAB-201ENST00000299314 SAMD15Q9P1V8 674 aa27.26■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP58Q5T655 872 aa27.26■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM13AO94988 1023 aa27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 RXRAP19793 462 aa27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
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GNPTAB-201ENST00000299314 CHRNA2Q15822 529 aa27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 C10orf67Q8IYJ2 551 aa27.25■■□□□ 1.95
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GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC160A6NGH7 325 aa27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 ST5P78524 1137 aa27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 DTHD1Q6ZMT9 781 aa27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 LINS1Q8NG48 757 aa27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 RFC4P35249 363 aa27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 PICALMQ13492 652 aa27.25■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPKBP1O60336 1514 aa27.24■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 PLCB3Q01970 1234 aa27.24■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEB6Q8N7X4 407 aa27.24■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNK9Q9NPC2 374 aa27.24■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 PLIN2Q99541 437 aa27.24■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
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GNPTAB-201ENST00000299314 CTNND2Q9UQB3 1225 aa27.23■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R7Q15435 360 aa27.23■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC25Q86WR0 208 aa27.23■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 IMPG2Q9BZV3 1241 aa27.23■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 TNNI2P48788 182 aa27.23■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 MSH6P52701 1360 aa27.22■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 KRBA2Q6ZNG9 492 aa27.22■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 CPA1P15085 419 aa27.22■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 NUP160Q12769 1436 aa27.22■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa27.22■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 MIGA1Q8NAN2 632 aa27.22■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 DAAM2Q86T65 1068 aa27.21■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.21■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS6KB1P23443 525 aa27.21■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.21■■□□□ 1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 F8W031 263 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
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