RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNA3P22001 575 aa25■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 WASHC4Q2M389 1173 aa25■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 C7orf43Q8WVR3 580 aa25■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 CD2APQ9Y5K6 639 aa25■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 USP26Q9BXU7 913 aa24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 CHGBP05060 677 aa24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K12Q12852 859 aa24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 EYA3Q99504 573 aa24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 SPON1Q9HCB6 807 aa24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 PIM2Q9P1W9 311 aa24.98■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHL34Q8N239 644 aa24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 C21orf2O43822 256 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 CD209Q9NNX6 404 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 SNED1Q8TER0 1413 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCF2Q9UG63 623 aa24.96■■□□□ 1.59
PACSIN3-201ENST00000298838 IL1R1P14778 569 aa24.95■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 ADD2P35612 726 aa24.95■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 APPBP2Q92624 585 aa24.95■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 RIMBP2O15034 1052 aa24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE3CQ15386 1083 aa24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC93Q567U6 631 aa24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.94■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE6AP16499 860 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 COA1Q9GZY4 146 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 MCCP23508 829 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 SOGA3Q5TF21 947 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.93■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 MAST3O60307 1309 aa24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.92■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 RAI14Q9P0K7 980 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 OSBP2Q969R2 916 aa24.91■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.9■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 JAG2Q9Y219 1238 aa24.9■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 G3V3G9 751 aa24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 M0R2C6 588 aa24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.89■■□□□ 1.58
PACSIN3-201ENST00000298838 PTH1RQ03431 593 aa24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 CHD4Q14839 1912 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 IGSF3O75054 1194 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMD1Q99460 953 aa24.88■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPA4P34932 840 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 DOK7Q18PE1 504 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP4K1Q92918 833 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 GPAA1O43292 621 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 PRDX5P30044 214 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.86■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 PODNQ7Z5L7 613 aa24.85■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 ANAPC15P60006 121 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 AOC3Q16853 763 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 AIDAQ96BJ3 306 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 PPIP5K2O43314 1243 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP7A1P22680 504 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 MECOMQ03112 1051 aa24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PACSIN3-201ENST00000298838 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms