RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297537.4

GBX1-201, Transcript of gastrulation brain homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GBX1, Length 1,092 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1-201ENST00000297537 MMP14P50281 582 aa29■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 VPS37DQ86XT2 251 aa29■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 PASKQ96RG2 1323 aa28.99■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 TIMM10P62072 90 aa28.98■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 SIRT2Q8IXJ6 389 aa28.98■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.98■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 ZBTB22O15209 634 aa28.97■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.97■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.97■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 JAG2Q9Y219 1238 aa28.97■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 CEP350Q5VT06 3117 aa28.96■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.96■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 OGFOD1Q8N543 542 aa28.96■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
GBX1-201ENST00000297537 A0A1B0GUL7 405 aa28.95■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 APLP1P51693 650 aa28.95■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 ADORA1P30542 326 aa28.94■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.93■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 GPR108Q9NPR9 543 aa28.93■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 SCARF1Q14162 830 aa28.92■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 XAGE2Q96GT9 111 aa28.92■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.92■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 PHKA1P46020 1223 aa28.91■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 CCDC102BQ68D86 513 aa28.91■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.9■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 ARAP2Q8WZ64 1704 aa28.89■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 WNT10BO00744 389 aa28.89■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.89■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.89■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.89■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
GBX1-201ENST00000297537 SEMA3EO15041 775 aa28.88■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 HMMRO75330 724 aa28.88■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 GRIK5Q16478 980 aa28.88■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.88■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.88■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 F8W031 263 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 TRAF5O00463 557 aa28.87■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 TNNI3KQ59H18 835 aa28.87■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.87■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 HTRA3P83110 453 aa28.86■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.86■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 GGA3Q9NZ52 723 aa28.86■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa28.85■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 USP48Q86UV5 1035 aa28.85■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 ERC1Q8IUD2 1116 aa28.85■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.85■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.85■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.85■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.84■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 CREBZFQ9NS37 354 aa28.84■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.84■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 RASGRF1Q13972 1273 aa28.83■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 DLGAP5Q15398 846 aa28.83■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 CFAP100Q494V2 611 aa28.83■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.83■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 MRIQ9BWK5 157 aa28.83■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.83■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GBX1-201ENST00000297537 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.82■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 CST9Q5W186 159 aa28.82■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.82■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 CRBNQ96SW2 442 aa28.82■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 SALL1Q9NSC2 1324 aa28.82■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.81■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 SPDYE6P0CI01 402 aa28.81■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 DLK2Q6UY11 383 aa28.81■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 DBNDD2Q9BQY9 259 aa28.8■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 ADM5C9JUS6 153 aa28.79■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 RAB11FIP3O75154 756 aa28.79■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 GORABQ5T7V8 394 aa28.79■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 SULF1Q8IWU6 871 aa28.79■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.79■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 CRKP46108 304 aa28.78■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.78■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.78■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.78■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 AOX1Q06278 1338 aa28.77■■■□□ 2.2
GBX1-201ENST00000297537 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms