RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 CORO7P57737 925 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PPARDQ03181 441 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC31Q6UY01 552 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 ADGRB1O14514 1584 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 NLRP12P59046 1061 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PSME1Q06323 249 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CASP8Q14790 479 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 LONRF3Q496Y0 759 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PSD3Q9NYI0 1048 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 MAP3K9P80192 1104 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 MTF1Q14872 753 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PNKPQ96T60 521 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CLIC4Q9Y696 253 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 EBAG9O00559 213 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CPLX1O14810 134 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 RNF40O75150 1001 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 USP8P40818 1118 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 MYL5Q02045 173 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 EFCAB13Q8IY85 973 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CRACR2AQ9BSW2 395 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 SUFUQ9UMX1 484 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CTAGE15A4D2H0 777 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 SPTLC2O15270 562 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CTAGE8P0CG41 777 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CTAGE6Q86UF2 777 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CTAGE4Q8IX94 777 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 KRT32Q14532 448 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 NBPF6Q5VWK0 638 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 NBPF4Q96M43 638 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 ZMYND10O75800 440 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PNOCQ13519 176 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 KLHL10Q6JEL2 608 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 KLHDC4Q8TBB5 520 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 IL17RAQ96F46 866 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 GBP3Q9H0R5 595 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CHGBP05060 677 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC175P0C221 793 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 SYKP43405 635 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PSEN1P49768 467 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 VSNL1P62760 191 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 FKBP15Q5T1M5 1219 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 GBP6Q6ZN66 633 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PPFIBP1Q86W92 1011 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CEP112Q8N8E3 955 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 C8orf76Q96K31 380 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 GJB4Q9NTQ9 266 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 SAMM50Q9Y512 469 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 GLI2P10070 1586 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PPFIA4O75335 1185 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 KIAA0754O94854 1291 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 C14orf37Q86TY3 774 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 ENGASEQ8NFI3 743 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PES1O00541 588 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 ATP2B2Q01814 1243 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PPP2R5AQ15172 486 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 FAM71BQ8TC56 605 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 SHTN1A0MZ66 631 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 SOWAHDA6NJG2 315 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 POTEB2H3BUK9 544 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 INPP5BP32019 993 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CAGE1Q8TC20 777 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CAPN7Q9Y6W3 813 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CTAGE9A4FU28 777 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CUTAO60888 179 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 EIF5P55010 431 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 ADALQ6DHV7 355 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 CAPZA3Q96KX2 299 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 UBXN6Q9BZV1 441 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 NEO1Q92859 1461 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PFKFB1P16118 471 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF827Q17R98 1081 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 SPECC1Q5M775 1068 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 VSTM4Q8IW00 320 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRR-201ENST00000283228 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms