RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 CHMLP26374 656 aa10.26□□□□□ -0.77
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PTPRB-201ENST00000261266 FAM193AP78312 1265 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 HAUS3Q68CZ6 603 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 CKAP2LQ8IYA6 745 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 ATP5DP30049 168 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 ANO6Q4KMQ2 910 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
PTPRB-201ENST00000261266 TSKSQ9UJT2 592 aa10.22□□□□□ -0.77
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