RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258398.8

TTLL4-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TTLL4, Length 4,730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-201ENST00000258398 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.29□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 IP6K1Q92551 441 aa10.29□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 IGSF3O75054 1194 aa10.29□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 CHMP4BP1P59074 171 aa10.29□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 SOGA3Q5TF21 947 aa10.29□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 KRBA2Q6ZNG9 492 aa10.29□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 CATIPQ7Z7H3 387 aa10.29□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 TSG101Q99816 390 aa10.29□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 CARD6Q9BX69 1037 aa10.29□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 VPS18Q9P253 973 aa10.29□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 KRT86O43790 486 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 HSF2BPO75031 334 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 FAM173BQ6P4H8 233 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC51Q96ER9 411 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 RNMTO43148 476 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 CLSTN1O94985 981 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 ZNF202O95125 648 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 STARD3NLO95772 234 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 PTH1RQ03431 593 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 AMPD3Q01432 767 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 POLA2Q14181 598 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 RILPL1Q5EBL4 403 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 ADGRB2O60241 1585 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 TFCP2Q12800 502 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 ISM2Q6H9L7 571 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 RASEFQ8IZ41 740 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 TMEM87BQ96K49 555 aa10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 IKBKBO14920 756 aa10.27□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 HAND2P61296 217 aa10.27□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 RTN1Q16799 776 aa10.27□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 COPS6Q7L5N1 327 aa10.27□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 TANGO6Q9C0B7 1094 aa10.27□□□□□ -0.76
TTLL4-201ENST00000258398 RTL9Q8NET4 1388 aa10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 TRIM75PA6NK02 468 aa10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 EBAG9O00559 213 aa10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 OAS2P29728 719 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 ODF2Q5BJF6 829 aa10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 BEND3Q5T5X7 828 aa10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 LRP2BPQ9P2M1 347 aa10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 RSPH14Q9UHP6 348 aa10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 WTAPQ15007 396 aa10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa10.27□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 PPP1R2P41236 205 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 ZNF569Q5MCW4 686 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 CHAMP1Q96JM3 812 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 TSGA10Q9BZW7 698 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 TMX1Q9H3N1 280 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 IGSF1Q8N6C5 1336 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 TACC1O75410 805 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 GNAT2P19087 354 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 RAB34Q9BZG1 259 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 LRRC27Q9C0I9 530 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 RCOR1Q9UKL0 485 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 JAK2O60674 1132 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 CMA1P23946 247 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 TMTC1Q8IUR5 882 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 TRIML1Q8N9V2 468 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 PPM1EQ8WY54 764 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 TTC14Q96N46 770 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 RTEL1Q9NZ71 1219 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 KCNH3Q9ULD8 1083 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 KIF5BP33176 963 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 RRAGBQ5VZM2 374 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 PLA2G4DQ86XP0 818 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 UNC5CLQ8IV45 518 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 RABGGTAQ92696 567 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 CALM1P0DP23 149 aa10.25□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 CALM2P0DP24 149 aa10.25□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 CALM3P0DP25 149 aa10.25□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa10.25□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa10.25□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa10.25□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 VPS36Q86VN1 386 aa10.25□□□□□ -0.77
TTLL4-201ENST00000258398 FAM76AQ8TAV0 307 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms