RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Llgl2Q3TJ91 1027 aa14.85□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Oog3Q3UWY1 500 aa14.85□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Kif22Q3V300 660 aa14.85□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Asap2Q7SIG6 958 aa14.85□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc4a1P04919 929 aa14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Npr3P70180 536 aa14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Irf6P97431 467 aa14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem130Q6NXM3 419 aa14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Abtb2Q7TQI7 1024 aa14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 4930504O13RikQ8C5Z9 145 aa14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lman1lQ8VCD3 505 aa14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tgm5Q9D7I9 724 aa14.84□□□□□ -0.03
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Wnt10bP48614 389 aa14.83□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc7a3P70423 618 aa14.83□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Spata18Q0P557 537 aa14.83□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 DbnlQ62418 436 aa14.83□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nlrp9aQ66X03 949 aa14.83□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Riok1Q922Q2 567 aa14.83□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Plagl1Q9JLQ4 704 aa14.83□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Chd5A2A8L1 1946 aa14.82□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa14.82□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trim27Q62158 513 aa14.82□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem179Q8BHH9 233 aa14.82□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem266Q8BZB3 538 aa14.82□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SisF8VQM5 1818 aa14.82□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Myh13B1AR69 1938 aa14.82□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 UncxO08934 530 aa14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prl7d1P04769 244 aa14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cxcl9P18340 126 aa14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 VegfbP49766 207 aa14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Abhd15Q5F2F2 459 aa14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pram1Q6BCL1 675 aa14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 VwdeQ6DFV8 926 aa14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sez6lQ6P1D5 963 aa14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SpidrQ8BGX7 933 aa14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Pcdhb5Q91XZ5 792 aa14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 NsmfQ99NF2 532 aa14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 AampJ3QN89 436 aa14.8□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tuft1O08970 390 aa14.8□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Prl3d1P18121 224 aa14.8□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Q3UJP5 209 aa14.8□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CrkQ64010 304 aa14.8□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam160b2Q80YR2 744 aa14.8□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mboat7Q8CHK3 473 aa14.8□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam84aQ9D650 292 aa14.8□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem79Q9D709 391 aa14.8□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm3893E9Q1I1 302 aa14.79□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Myo1bP46735 1107 aa14.79□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 AsnsQ61024 561 aa14.79□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa14.79□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc26a8Q8R0C3 999 aa14.79□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 ParnQ8VDG3 624 aa14.79□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Scn10aQ6QIY3 1958 aa14.78□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Adam7O35227 789 aa14.78□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Stat5bP42232 786 aa14.78□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Akap4Q60662 849 aa14.78□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sik3Q6P4S6 1311 aa14.77□□□□□ -0.04
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Map3k12Q60700 888 aa14.77□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ube3cQ80U95 1083 aa14.77□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Krt25Q8VCW2 446 aa14.77□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tm4sf4Q91XD3 202 aa14.77□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Celf2Q9Z0H4 508 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mroh6V9GX81 722 aa14.77□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 TnksQ6PFX9 1320 aa14.76□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa14.76□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tll1Q62381 1013 aa14.76□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nme8Q715T0 586 aa14.76□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 RubcnQ80U62 956 aa14.76□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Uba5Q8VE47 403 aa14.76□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa14.76□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Col20a1Q923P0 1320 aa14.75□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gxylt1Q3UHH8 404 aa14.75□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tm4sf1Q64302 202 aa14.75□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ube3bQ9ES34 1070 aa14.75□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Myh3P13541 1940 aa14.74□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Aox4Q3TYQ9 1336 aa14.74□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 AU019823E9PUQ3 292 aa14.74□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fgl2P12804 432 aa14.74□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fdx1P46656 188 aa14.74□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ankrd13cQ3UX43 541 aa14.74□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Micall1Q8BGT6 870 aa14.74□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cluap1Q8R3P7 413 aa14.74□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Jag1Q9QXX0 1218 aa14.74□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa14.73□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Taok2Q6ZQ29 1240 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.9 ms