RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 RPS4Y2Q8TD47 263 aa23.46■■□□□ 1.35
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM106AQ96A25 262 aa23.46■■□□□ 1.35
SEMA3B-215ENST00000621029 CLEC7AQ9BXN2 247 aa23.46■■□□□ 1.35
SEMA3B-215ENST00000621029 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa23.46■■□□□ 1.35
SEMA3B-215ENST00000621029 FBLN5Q9UBX5 448 aa23.46■■□□□ 1.35
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 GABRPO00591 440 aa23.45■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 HSPB6O14558 160 aa23.45■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 RSU1Q15404 277 aa23.45■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 Q6P435 159 aa23.45■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 OR2T6Q8NHC8 308 aa23.45■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 PIFOQ8TCI5 191 aa23.45■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF281Q9Y2X9 895 aa23.45■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 VGLL3A8MV65 326 aa23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 MMP23AO75900 390 aa23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 CDK2P24941 298 aa23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC34A1Q06495 639 aa23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 OR52W1Q6IF63 320 aa23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 PXT1Q8NFP0 134 aa23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 SMIM19Q96E16 107 aa23.44■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ODAMA1E959 279 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD65E5RJM6 399 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 H0YJX3 145 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 F2RL2O00254 374 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 CHST1O43916 411 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 CAPGP40121 348 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ST3GAL4Q11206 333 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 MINOS1Q5TGZ0 78 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF529Q6P280 563 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 OR10K1Q8NGX5 313 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 GGHQ92820 318 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TAS2R3Q9NYW6 316 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 PITPNC1Q9UKF7 332 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ING4Q9UNL4 249 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TCF19Q9Y242 345 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa23.43■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 OGG1O15527 345 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 HTR1DP28221 377 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 PTGFRP43088 359 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 KIR2DS4P43632 304 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM219Q86XT9 240 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ABHD12Q8N2K0 398 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ZFP41Q8N8Y5 198 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 DTX3Q8N9I9 347 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 OR13C5Q8NGS8 318 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 OR52N1Q8NH53 320 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 GHSRQ92847 366 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 S100A13Q99584 98 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM138Q9NPI0 162 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa23.42■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM172BPA6NC97 362 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 EFCAB10A6NFE3 127 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 HTR3BO95264 441 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 LALBAP00709 142 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 CSN2P05814 226 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 OR3A4PP47883 348 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 DDI2Q5TDH0 399 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ELP2Q6IA86 826 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 Q6ZTK2 550 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 OR4D6Q8NGJ1 314 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 CORO2AQ92828 525 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 COQ2Q96H96 371 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 VCXQ9H320 206 aa23.41■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 CDRT1O95170 752 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 GNAO1P09471 354 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 BDKRB2P30411 391 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 HEPN1Q6WQI6 88 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ORAI1Q96D31 301 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 OR6C3Q9NZP0 311 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 CKLFQ9UBR5 152 aa23.4■■□□□ 1.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TOR1AO14656 332 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 ALDOBP05062 364 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 PIGYQ3MUY2 71 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 C11orf88Q6PI97 169 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 RTN4RL2Q86UN3 420 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 STX19Q8N4C7 294 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF596Q8TC21 504 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 CDCA4Q9BXL8 241 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 METTL9Q9H1A3 318 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 DSCAML1Q8TD84 2053 aa23.39■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 MEIKINA0A087WXM9 373 aa23.38■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa23.38■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 A6NDX4 124 aa23.38■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 H3BUI4 141 aa23.38■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 XPNPEP2O43895 674 aa23.38■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 CSTBP04080 98 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 VSIG10L2P0DP72 767 aa23.38■■□□□ 1.33
SEMA3B-215ENST00000621029 GLP1RP43220 463 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms