RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 OR10S1Q8NGN2 331 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 OIT3Q8WWZ8 545 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 GPHA2Q96T91 129 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CD207Q9UJ71 328 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 NSG2Q9Y328 171 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 PPP5D1E7EU14 171 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CTLA4P16410 223 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 GFERP55789 205 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 RAC1P63000 192 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 KCNMB1Q16558 191 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CBLN3Q6UW01 205 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 Q6ZSR6 202 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SULF2Q8IWU5 870 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 BMFQ96LC9 184 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1456Q9P272 454 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ATRXP46100 2492 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 A0A0J9YY10 115 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 M0QZK8 103 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 DDAH2O95865 285 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CDKN1AP38936 164 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 GTF3C1Q12789 2109 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf140Q5VVS0 124 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CLEC1BQ9P126 229 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 VAX2Q9UIW0 290 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRT-211ENST00000618610 CUBNO60494 3623 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PQF6 199 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFB8O95169 186 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF74Q16587 644 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 S100A7AQ86SG5 101 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 GPER1Q99527 375 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 AKAP13Q12802 2813 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 IGSF23A1L1A6 192 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF320A2RRD8 509 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 H3BP45 60 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 PRSS12P56730 875 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 GABREP78334 506 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 FMODQ06828 376 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-211ENST00000618610 BCORP1Q8N888 145 aa7.14□□□□□ -1.27
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