RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087X0M5 115 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GX30 115 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ODAMA1E959 279 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 TOR1AO14656 332 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 LMO1P25800 156 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGFRP43088 359 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 THBS3P49746 956 aa20.32■□□□□ 0.84
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CAPNS1-211ENST00000590874 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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CAPNS1-211ENST00000590874 KRBOX4Q5JUW0 171 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 C8orf86Q6ZUL3 223 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2W3Q7Z3T1 314 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5D18Q8NGL1 313 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SPSB1Q96BD6 273 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SPACA5Q96QH8 159 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A12PA8MX19 464 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 G3V2T6 193 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CSN2P05814 226 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A15PP0C7V4 464 aa20.29■□□□□ 0.84
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CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A14PP0C7W9 464 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A24PP0C7X0 464 aa20.29■□□□□ 0.84
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CAPNS1-211ENST00000590874 FAM220AQ7Z4H9 259 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2G2Q8NGZ5 317 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 NFYBP25208 207 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1E1P36543 226 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM244Q5VVB8 128 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 OR56B4Q8NH76 319 aa20.28■□□□□ 0.84
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CAPNS1-211ENST00000590874 RPEQ96AT9 228 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 KIRREL1Q96J84 757 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 MBOAT4Q96T53 435 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FRRS1LQ9P0K9 344 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 TENM3Q9P273 2699 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6AP1Q15904 470 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 THNSL2Q86YJ6 484 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf56Q8N8D9 126 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10AC1Q8NH08 325 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 OR9G1Q8NH87 305 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CIB1Q99828 191 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00527Q9UJ94 153 aa20.27■□□□□ 0.84
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CAPNS1-211ENST00000590874 CHST4Q8NCG5 386 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51A4Q8NGJ6 313 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13C9Q8NGT0 318 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 LEAP2Q969E1 77 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 EME1Q96AY2 570 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RX4Q99571 388 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPI3 338 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT19A8MXV4 375 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV3-7P01780 117 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 OCM2P0CE71 109 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-211ENST00000590874 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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