RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 F5H5K5 113 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SYNGR3O43761 229 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SSX5O60225 188 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 JTBO76095 146 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SYNGR4O95473 234 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 DIRAS3O95661 229 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 HPNP05981 417 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CCL3P10147 92 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PTHLHP12272 177 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 AKR1C4P17516 323 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 TUBG1P23258 451 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 KIR2DS4P43632 304 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR3A4PP47883 348 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RAB5CP51148 216 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CLDN15P56746 228 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PLA2G7Q13093 441 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 KIR2DS1Q14954 304 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 HMGN3Q15651 99 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MICBQ29980 383 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 BAP18Q8IXM2 172 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 LRTM2Q8N967 370 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ARL11Q969Q4 196 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 GALNT14Q96FL9 552 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 REEP6Q96HR9 211 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FOXB1Q99853 325 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SPIN2AQ99865 258 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 LDAHQ9H6V9 325 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 EHFQ9NZC4 300 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MBD2Q9UBB5 411 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZNF716A6NP11 495 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 C17orf51A8MQB3 221 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PRRG2O14669 202 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ACTL6AO96019 429 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 NRASP01111 189 aa6.92□□□□□ -1.3
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GGA3-218ENST00000584243 CDAP32320 146 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 HTR5AP47898 357 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 BLOC1S1P78537 153 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MPV17LQ2QL34 196 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 GPR157Q5UAW9 335 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ELP2Q6IA86 826 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 KCTD9Q7L273 389 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 SVBPQ8N300 66 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 Q8NFD4 153 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.92□□□□□ -1.3
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GGA3-218ENST00000584243 DCUN1D4Q92564 292 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 RND1Q92730 232 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.92□□□□□ -1.3
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GGA3-218ENST00000584243 ADGRG7Q96K78 797 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 GNRHR2Q96P88 292 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 LYSTQ99698 3801 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 PECRQ9BY49 303 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 CRLF2Q9HC73 371 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 GLRX2Q9NS18 164 aa6.92□□□□□ -1.3
GGA3-218ENST00000584243 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.92□□□□□ -1.3
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