RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 COMMD9Q9P000 198 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 NUP50Q9UKX7 468 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FZR1Q9UM11 496 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 H0YL77 283 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 KLK10O43240 276 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMPD2O60906 423 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FUT3P21217 361 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FCGR2CP31995 323 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 AARDQ4LEZ3 155 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 EXTL1Q92935 676 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF126Q9BV68 326 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 MSGN1A6NI15 193 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 AQP7O14520 342 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 HS3ST1O14792 307 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CEACAM4O75871 244 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 MPV17P39210 176 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 NBL1P41271 181 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAS2R31P59538 309 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 S100A12P80511 92 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 BVESQ8NE79 360 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 WNT2BQ93097 391 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RELNP78509 3460 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 A8MXK9 166 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RRP8O43159 456 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CRHP06850 196 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 SCTP09683 121 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZP3P21754 424 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPA1Q15181 289 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZT83 130 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 WDR31Q8NA23 367 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RDH5Q92781 318 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A0B4J2A0 478 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 APOC3P02656 99 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TFF1P04155 84 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FGF2P09038 288 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 DTYMKP23919 212 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 FGF12P61328 243 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PPP1CBP62140 327 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARL6IP1Q15041 203 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q8NFD4 153 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 DCUN1D4Q92564 292 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TECTBQ96PL2 329 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 LHX6Q9UPM6 363 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CADP27708 2225 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACACAQ13085 2346 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TNFSF13O75888 250 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 AADACP22760 399 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSMB6P28072 239 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PIGPP57054 158 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RTP5Q14D33 572 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 HERPUD1Q15011 391 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 BCL2L11O43521 198 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFA2O43678 99 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A4P12235 298 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 HOXC12P31275 282 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSG7Q13046 419 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-210ENST00000566882 RTL6Q6ICC9 239 aa8.65□□□□□ -1.02
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