RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	CORO2A	Q92828	525 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	PPA2	Q9H2U2	334 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	ODAM	A1E959	279 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	DEGS1	O15121	323 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	XPNPEP2	O43895	674 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	GPX5	O75715	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	TAS2R43	P59537	309 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	SCN1B	Q07699	218 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	RSU1	Q15404	277 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784		Q499Y3	187 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	TFAP2C	Q92754	450 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	GHSR	Q92847	366 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	COQ2	Q96H96	371 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	IL36G	Q9NZH8	169 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKD1-231	ENST00000566784	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	PAX6	P26367	422 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	BDKRB2	P30411	391 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	PTGFR	P43088	359 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	GLIPR1	P48060	266 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	DYNLT3	P51808	116 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	AES	Q08117	197 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	RIPK1	Q13546	671 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	LY6E	Q16553	131 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	DDI2	Q5TDH0	399 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	AHSA2	Q719I0	299 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	STX19	Q8N4C7	294 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784		H0YJX3	145 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	MYL12B	O14950	172 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	MMP23A	O75900	390 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	CD1A	P06126	327 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	FST	P19883	344 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	OR3A4P	P47883	348 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	KCNJ3	P48549	501 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	WNT4	P56705	351 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	PAX5	Q02548	391 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	SSX2	Q16385	188 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	DTX3	Q8N9I9	347 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	CKLF	Q9UBR5	152 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	VWF	P04275	2813 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	TIMM23	O14925	209 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	CHST1	O43916	411 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	CDRT1	O95170	752 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	HTR3B	O95264	441 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKD1-231	ENST00000566784	CDK2	P24941	298 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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