RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM56	Q96MV1	263 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	WFDC1	Q9HC57	220 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		15.85	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	TRDC	B7Z8K6	153 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-9	P01782	118 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	GNRHR	P30968	328 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DS4	P43632	304 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ID4	P47928	161 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	KIR2DS1	Q14954	304 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF11	Q5DX21	431 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	MKX	Q8IYA7	352 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559		Q9N2K0	584 aa		15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	15.84	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559		C9JQL5	133 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SYNGR4	O95473	234 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	NAPSA	O96009	420 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PRH1	P02810	166 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	BCL3	P20749	454 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	HAAO	P46952	286 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PPT1	P50897	306 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF266	Q14584	549 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	GUK1	Q16774	197 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	SPINK14	Q6IE38	97 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF695	Q8IW36	515 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	LFNG	Q8NES3	379 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	TAAR9	Q96RI9	348 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	OPA3	Q9H6K4	179 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		15.83	■□□□□ 0.13
RRN3-205	ENST00000563559	PRKACA	P17612	351 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	LHX2	P50458	406 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	OR2C3	Q8N628	320 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	OR2M7	Q8NG81	312 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SLAMF9	Q96A28	289 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	BOD1	Q96IK1	185 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf49	A4QMS7	147 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	NME2P1	O60361	137 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	CRYBA1	P05813	215 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	CCNO	P22674	350 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	KCNJ3	P48549	501 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	NHLH2	Q02577	135 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	DDA1	Q9BW61	102 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PLK3	Q9H4B4	646 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ABI3	Q9P2A4	366 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	FOLR2	P14207	255 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ARR3	P36575	388 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	GPM6A	P51674	278 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00596	Q86U02	117 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	RNF122	Q9H9V4	155 aa		15.82	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		15.81	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	NEURL1	O76050	574 aa		15.81	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN18	P56856	261 aa		15.81	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SRY	Q05066	204 aa		15.81	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		15.81	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		15.81	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		15.81	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559		A0A096LPE4	126 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPZ6	126 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	COLCA2	A8K830	154 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF724	A8MTY0	619 aa		15.8	■□□□□ 0.12
RRN3-205	ENST00000563559	F10	P00742	488 aa		15.8	■□□□□ 0.12

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