RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562205.1

RNPS1-206, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 2,223 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-206	ENST00000562205	SRY	Q05066	204 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	GUK1	Q16774	197 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	TMEM45B	Q96B21	275 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	KPTN	Q9Y664	436 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205		B4E171	279 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	LMO1	P25800	156 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	TSPAN7	P41732	249 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	GPM6A	P51674	278 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	PRDX4	Q13162	271 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205		Q8NFD4	153 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	LUZP4	Q9P127	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	ZNF98	A6NK75	572 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	HLA-H	P01893	362 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	SCT	P09683	121 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	PMEL	P40967	661 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	C14orf79	Q96F83	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	BIN3	Q9NQY0	253 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205		A0A1B0GV50	99 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	HSPB6	O14558	160 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	SERPINA7	P05543	415 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	SPINK2	P20155	84 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	HAAO	P46952	286 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	AWAT1	Q58HT5	328 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	HES7	Q9BYE0	225 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	RNF122	Q9H9V4	155 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205		Q9N2K0	584 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	IGSF23	A1L1A6	192 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	C5orf49	A4QMS7	147 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	PRH1	P02810	166 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	LRFN1	Q9P244	771 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	MUC3A	Q02505	3323 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	NAPSA	O96009	420 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	CLINT1	Q14677	625 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	SSPN	Q14714	243 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	GNMT	Q14749	295 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	TGIF1	Q15583	401 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	TSC22D1	Q15714	1073 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	GAPT	Q8N292	157 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	COMMD1	Q8N668	190 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-206	ENST00000562205	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	CDS2	O95674	445 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	LHX2	P50458	406 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	FGF12	P61328	243 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205		Q6ZS49	121 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RNPS1-206	ENST00000562205	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.71	□□□□□ -0.22

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