RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFA8	P51970	172 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	H2BFS	P57053	126 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RWDD2B	P57060	319 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNG7	P62955	275 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF45	Q02386	682 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R1A	Q13522	171 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	HERPUD1	Q15011	391 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRK	Q15262	1439 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SHH	Q15465	462 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957		Q499Y3	187 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	LIN52	Q52LA3	116 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf195	Q5TG92	126 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	MARC1	Q5VT66	337 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OTP	Q5XKR4	325 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	COMMD7	Q86VX2	200 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A45	Q8N413	288 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4X1	Q8NH49	305 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10A6	Q8NH74	314 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10D3	Q8NH80	312 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC29	Q8WV35	223 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CYGB	Q8WWM9	190 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TCEAL3	Q969E4	200 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TMBIM1	Q969X1	311 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	FMC1	Q96HJ9	113 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SPACA5	Q96QH8	159 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR52E6	Q96RD3	313 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PAXX	Q9BUH6	204 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PECR	Q9BY49	303 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR51I1	Q9H343	314 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	DMAC2	Q9NW81	257 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	DKKL1	Q9UK85	242 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PPR1	153 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CD300LB	A8K4G0	201 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR11H12	B2RN74	326 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	MANBA	O00462	879 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SPAG7	O75391	227 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	STK16	O75716	305 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CNIH1	O95406	144 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IGKV5-2	P06315	115 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYGD	P07320	174 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	IFI30	P13284	250 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ELK4	P28324	431 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS3	P35030	304 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CTRL	P40313	264 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1E2	P47887	323 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PSME3	P61289	254 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC7A9	P82251	487 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SPCS2	Q15005	226 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	BATF	Q16520	125 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	GUCA2B	Q16661	112 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF404	Q494X3	552 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL9	Q6T311	187 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM86B	Q8N661	226 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR11H1	Q8NG94	326 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR11H2	Q8NH07	326 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	CCL17	Q92583	94 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PHB2	Q99623	299 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	MRO	Q9BYG7	248 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	OR51I2	Q9H344	312 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	INIP	Q9NRY2	104 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM100	Q9NV29	134 aa		2.03	□□□□□ -2.08
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR34	Q9NV39	138 aa		2.03	□□□□□ -2.08

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