RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 HMGN4O00479 90 aa9.6□□□□□ -0.87
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SEMA4B-204ENST00000558065 Q499Y3 187 aa9.59□□□□□ -0.87
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SEMA4B-204ENST00000558065 OR1D2P34982 312 aa9.58□□□□□ -0.88
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SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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